生物医学工程是一门综合运用工程学和生命科学的原理与方法，研究开发用于疾病诊断、治疗、康复的各种工程技术和方法的交叉学科。广州医科大学生物医学工程学科依托基础医学、临床医学等重点学科，整合呼吸疾病全国重点实验室及省部级重点实验室资源，聚焦呼吸系统疾病诊疗难题，构建“校-企-医-孵”协同创新模式，重点攻关智能医疗电子、生物医学材料、组织工程及医学信息领域，形成“临床需求-技术研发-产业转化”全链条学科特色，引领医工交叉前沿方向。2021年入选广东省高等教育“冲一流、补短板、强特色”提升计划重点建设学科，与学科密切相关的材料科学已进入ESI全球前1%。

历经20年深耕，学科建设实现跨越式突破。2004年创立，2005年招收首届本科生，2018年获批一级学科硕士点，2019年入选广东省特色专业，2021年入选国家级一流专业及省级重点学科，2024年跻身“软科世界一流学科排名”全球前100（国内医科院校前5）。2024年学生获国家级竞赛奖项10项，省级奖项37项。

学科汇聚海外院士、国家杰青/优青等国家级人才23人次，省级人才11人次，44%教师具有海外背景，27人通过“南山学者”计划引进，学科交叉覆盖医学、材料、电子、生物等多领域，形成医工复合型人才梯队。

科研成绩显著，转化成效突出。近三年承担国家级项目27项（含重点重大类7项）、省市级35项，项目经费累计7189万元，发表中科院一区论文200余篇，授权专利76项，10项成果临床转化，包括深静脉血栓智能诊断系统、载药气道支架、3D生物打印技术及PCL导电材料等，部分成果已经成立公司进行转化和推广。其中谢茂彬教授团队研发的国内首台商业化体积打印设备OrganSEC技术指标达到国际一流，填补了国内空白，其发布信息被刊登在《人民日报》2024年8月30日第11版，受到多家媒体的广泛关注与报道。