广州医科大学消化病研究所成立于2019年9月，2022年5月建成并投入使用，是学校和医院的科技创新共享平台之一，承担着本科生、研究生教学和实习任务，为人才培养、科技创新提供技术支撑和设备保障。

消化病研究所位于医院1号住院楼D区1楼，总建筑面积约850平方米。分为综合办公区和实验区两部分。实验区设有更衣室、中心实验区、细胞室、PCR室、仪器室、功能材料室、危化品室、低温冰箱室、4度操作室、洗消间。实验区有8组实验台，配备了纯水仪、离心机、蛋白电泳设备等。细胞培养室有3个独立的万级细胞培养间，配备有生物安全柜、细胞培养箱、离心机、荧光显微镜、全自动细胞计数仪。仪器室配备有激光显微切割仪、纳米流式检测仪、细胞核转染仪、全波长酶标仪等仪器，设备总值900余万。