广东省过敏反应与免疫重点实验室是广州医科大学更名后举全校之力首个建设的省级重点实验室，由广医二院、广医一院、广州霍夫曼免疫研究所等相关研究力量组成。2009年成为呼吸疾病国家重点实验室成员，2011年成为广州市重点实验室，2013年成为广东省重点实验室，2013年实验室依托的两家过敏反应科同时成为变态反应国家临床重点专科并于2018年通过验收。2015年得到广州市科创委支持建立“广州市过敏反应转化医学研究中心”。2018年获省卫健委立项为“广东省变态反应及免疫性疾病转化医学创新平台”。目前实验室常驻研究人员49名，40多名研究生常驻实验室。

实验室涵盖广州医科大学临床医学一级学科博士点和基础医学一级学科博士点和以免疫学为龙头的多个硕士点，学术氛围浓厚，对外交流频繁。学术委员会由来自北京301医院免疫学家王小宁教授、UCSD的EyalRaz教授和长江学者何韶衡教授、钟南山院士等专家担任，还聘任数名外籍著名教授作为实验室特聘/客座教授。与国内外30余家单位建立了深厚的合作关系，是有志青年进修学习与科研的理想场所。除培养进修生、对口帮扶下级医院等实践教学内容外，还通过课堂教学培养本专科生、硕士生、博士生、博士后乃至千百十人才培养对象等不同层次的人才，联合培养数十名来自其他211、985高校等单位的客座硕士生博士生，从而形成教学系统全面、教学平台开放、教学内容精专、教学效果良好的特色实验室。实验室主要实验场所在广州医科大学越秀校区10号楼3楼，实验室自身硬件配置高档齐备，同时，主体依托呼吸疾病重点实验室大平台，能顺畅使用该实验室的仪器设备和共享技术。实验室课题经费充足，在研国家重大科技专项课题等课题数十项，近三年可支配的纵向研究经费3700多万元。

实验室形成了具有鲜明特色的过敏原性医学评测与改良及免疫学基础研究的技术平台。自主开发了过敏原生物信息学判别软件SORTALLER (http://sortaller.gzhmu.edu.cn)，准确性国际领先，被国际上30多个发达国家和港澳台在内的国内20多家单位的研究者持续应用。近年获得国家发明专利2项、计算机软件著作1项；获广东省科技进步二等奖和广州市科学技术一等奖各1项，发表相关论文百余篇。2015年在Springer出版国际第一本变态反应生物信息学专著《Allergy Bioinformatics》,被下载9900多次。同时，强化基础与临床的结合，汇集全校在天然免疫、特别是感染免疫及肿瘤免疫方面的研究资源，形成与过敏反应研究齐头并进的重要力量。

目前实验室的研究方向及优势力量主要集中在如下四个方面：“过敏原的致病机理研究”、“过敏性疾病的新型防诊治方法研究”、“感染及肿瘤成因的免疫学机制研究”、“炎症与免疫性疾病的基础研究”。